27.07.2014 - Buralara bayram havası esti...

Yine yeni yeniden hepinize merhabalar...

Biz biyoinformatik stajyerlerini evlerine dağıtan bayram tatilinin içindeyiz. Herkes ailelerinin yanında ve oldukça iyi vakit geçiriyor. Hepimizin tek şikâyeti ise tatilimizi yaparken, bu stajdan uzak kalıyor olmamız. Bir günümüz ayrı geçti ama tüm gün mesajlaşmalarımız devam etti. İkinci ailemizin her bireyi diğer bireylerini şimdiden çok fazla özledi. Tatilin biran önce bitmesini, bittiğinde ise tekrar bizleri bekleyen o tatlı sunumlarımıza, bilgi dolu derslerimize, hayat tecrübesi kokan skype görüşmelerimize, en lezzetli soslardan yapılmış programlama derslerimize, beraberliğin güzelliğiyle anlam kazanan filmlerimize ve oyunlarımıza bir an önce kavuşmayı çok istiyoruz. (=

21 Temmuz Haftası

Zaman çok çabuk geçiyor. Çalışmalarımızın 7. haftasını bitirmişiz, ancak sanki daha dün başlamış gibiyim. Üstelik çalışmalarımız boyunca geçirdiğimiz her bir gün aslında sıradan üç güne bedel. Yüksek motivasyonla saatler boyunca durmadan çalışıyoruz. Hatta bu durumun başlarda biraz yadırgandığını bile söyleyebilirim. Bir devlet kurumunda insanların neden sabaha karşı 4'e kadar çalıştığı eminim birçok kişinin kafasında soru işaretiydi, ancak artık insanlar gerçekten de bu işi sevdiğimizi biliyorlar. Temmuz Grubu'nun da aramıza katılmasıyla neredeyse 24 saat boyunca bizden birileri bulunuyor binada, motivasyonumuzun ne düzeyde olduğunu varın siz düşünün. Bu ne bir kuralla, ne de bir zorlamayla oluşturulabilecek bir çalışma düzeni değil; ekibimizin çalışmaya ve öğrenmeye ne kadar hevesli olduğunun bir göstergesi.

Çalışma ortamının sağlıklı olması da bu düzenin devam edebilmesi için en temel faktörlerden birisi, ve bunun için GenKök'e olan şükranlarımızı ne kadar ifade etsek az. Üniversite Rektörümüzün vizyonuyla şekillendirilen ve Ankara'nın doğusunda görmeye pek alışık olmadığımız ancak gelişmiş araştırma merkezlerindeki altyapıları aratmayan bir tarzda ortaya çıkarılmış bu bina ve kültürden övgüyle bahsetmek gerek. Merkez yöneticilerimizin tamamı ve çalışanların bir kısmının gayretleriyle hayata geçirilen bu eseri bir fırsatını bulursanız mutlaka görmenizi isterim. Çalışanların bir kısmı dedim, çünkü az sayıda da olsa diğer bir kısmı klasik devlet memuru kafasıyla mümkün olduğunca işten kaçıyor ve en fazla 15 dakikada tamamlanacak işler için 3 gün sonrasına randevu veriyor. Bu durumdan oldukça muzdaribim ancak yapılan onca güzel işi gölgelemesin diye daha fazla bahsetmek istemiyorum.

24 Temmuz

Herkese merhaba,

Bugün temamız ayrılık ve tatil psikolojisine geçiş. Ekibimizden Haziran grubu yavaş yavaş ayrılıyor. Birlikte yoğun 3 hafta geçirince ayrılmak daha da zor oldu. Bugün Cansu ve Emre'yi uğurladık. 3 tane bozulmuş 1000 parçalık puzzle bitmeden bırakmadık tabi ki:) Başladığı işi bitirmeden bırakmayan biyoinformatik ekibi olarak puzzle tamamlama heyecanıyla sabahladık. Puzzle bahane ekip olmak şahane :) 

24 Temmuz- "Ne Stajdı Ama!"

Herkese Merhaba,

Bugün stajı bitmiş biri olarak yazıyorum. Tüm staj boyunca ne yaptığımız, neler kazandığım hakkında bir şeyler paylaşmayı düşünüyorum sizlerle. Keyifli okumalar :).

Hayatımın en güzel, keyifli, farklı ve öğretici staj programıydı. Ahmet Hocamız sağolsun çok düşünmüş ve çok iyi bir program hazırlamış bizim için. Her birimizle çok özel olarak ilgilendi ve çok büyük emek sarfetti. Bize bu fırsatı sağladığı için kendisine ne kadar teşekkür etsem yetersiz kalacağını biliyorum. Türkiye şartlarında kendisi türünün tek örneği diyebilirim :). Kendisinden eğitim almaktan hem de tanımaktan çok memnun oldum. Bizim için hocadan da öte hem bir abi hem de arkadaş oldu. 

14 Temmuz Haftası

İnsan en iyi yaparak öğrenir derler, bu nedenle çalışmalarımızın odağı "yapmak". 14 Temmuz haftasının da bence en önemli dersini takım oyunumuzla içselleştirdik. Detaylarını bloglarda okumuşsunuzdur, amacımız takım çalışmasında dikkat edilmesi gereken kuralların ne olduğu ve bu kurallara aykırı hareket edildiğinde ortak bir amaca ulaşmanın ne denli zor olduğuydu. Özellikle son oyunumuzda, tek bir merkezden idare edilen süreçlerde bu merkezin kararlarını yetersiz bulan ikinci bir karar mekanizmasının devreye girmesi sonucunda yine de ortak hedefe ulaşılamadığını görmüş olduk. Tabii ki bu sadece bir oyundu, ancak sanırım herkes hissesine düşen dersi aldı.

23 Temmuz

Yeniden merhaba,

Ayrılık rüzgarlarının estiği bu haftamızda hepimiz biraz yorgunuz, muhtemelen bayram tatilinin psikolojik etkisi. Bu günümüz yaptığımız ayrı ayrı çalışmalar ve gidişlerle geçti.

Bugün yine öğlen başladık çalışmaya. Herkes kendi işine bakıyordu: Bihter ve ben bir süredir uğraştığımız işlere devam ettik, Cansu kendi proje çalışmalarına, Emre puzzle'a, Temmuz grubu kod yazmaya ve Ahmet Hoca da hepimize :) Akşam yemeğindeki pizza partimize kadar böyleydik ki o zamana kadar herkes epeyce ilerlemişti. Pizzadan sonra ise veda zamanları vardı: Haziran grubu iki üyesini daha temelli uğurladı. Ben bugün ayrılıklarımızdan bahsetmek istiyorum.

23.07.2014

Burada neler yaptığımızı merak eden herkese yeniden merhaba,

Yine her çarşamba olduğu gibi yazma sırası bende. Günler oldukça yoğun ve hızlı geçiyor hatta yetmiyor bile diyebilirim. Çok yoğun geçen son iki günden sonra oldukça yorulduk. Yeni şeyler öğrendikçe kafamız karışmaya başlıyor diyebilirim. Özellikle "D3" ve "Bayseian istatistiği" kafamı yeterince karıştıran konular oldu. Ama zor diye pes etmek yok daha uzun bir yolun başındayız. Skype konuşmaları da bizim için oldukça faydalı geçiyor ve her konuşmada kendimize önemli dersler çıkarıyoruz. Kısacası burada günler yorucu, öğretici ve eğlenceli geçiyor.

21.07.2014 - Ekip Ruhu

Merhabalar....

Yeni bir günün ışığını yüzümde hissederek uyandım. Uykusuz, yorgun gecelerin ardından enerjimi toplamaya çalışarak güne başladım. Uykusuzluk gözlerimi açmamı zorluyordu. Uykulu bir halde Gen Kök'e geldim. Gözlerim birden açıldı. O da ne? Puzzle'larımız bozulmuş, koyduğumuz yerden yanlışlıkla düşmüş ve dağılmışlardı. Grup olarak baya üzüldük ama tekrar yapmak için uğraşmaya başladık.

22 Temmuz

Yine yoğun geçen bir salı gününün ardından herkese merhaba,

Gelecek hafta bayram nedeniyle stajımıza kısa bir ara vereceğimiz için günlerimizi en verimli şekilde geçirmeye çalışıyoruz şu sıralar. Bugün yaptıklarımızı olabildiğince kısa anlatmaya çalışacak olsam da şimdiden uzun bir yazı olabileceği konusunda sizi uyarayım.

Normalde farklı günlerde yaptığımız iki Skype görüşmemizi bu hafta için bir güne sığdırdık. İlk görüşmemizi Bilkent Üniversitesi'nde doçent olarak görev yapmakta olan Michelle Adams ile gerçekleştirdik. İngilizce olarak gerçekleşen konuşmada yabancı bir hocanın gözünden Türkiye'deki koşullarla yurt dışındaki koşulların lisans, yüksek lisans ve doktoradaki farklılıklarını dinlemiş olduk. Bunun yanında Michelle Adams aramızdan yurt dışında çalışmayı isteyenler için de birkaç tavsiyede bulundu. Yurt dışı eğitimlerini gözümüzde büyütmeyip ne olursa olsun her zaman başvurmak ve bir problem olduğunda kendimizi çıkmazda hissetmeyip problemle başa çıkmaya çalışmak bu tavsiyelerden bazılarıydı.

21 Temmuz Pazartesi - Planlar ve D3js

                                               "Siz planlar yaparken, Tanrı da size yukarıdan kahkahalar atar."

Bu sıralar yukarıdaki sözün doğruluğunu kendini sürekli gösteriyor. Mesela pazartesi günü yazmam gereken bu yazıyı, salıyı çarşambaya bağlayan gece bilgisayarımın başına anca oturup akrep 3ün üstüne geldiğinde yazabildim. Yoğun bir pazartesi günü geçirdim. Derin bir nefes alıp neler yaptığımızı anlatmaya haydi başlayalım.  

22 Temmuz

Merhaba;

İnsanoğlu her alanda farklı görüşlerde de olsa genel bir düşünce kıyaslandığında genellikle iki gruba ayrılır. Bu ifadeyi biraz daha açıklayacak olursam, bugün izlediğimiz Maymunlar Cehennemi: Başlangıç filminin sonunda film eleştirisi üzerine gerçekleştirilen ve aslında bir zamandan sonra herkesin kendi dünya görüşünü satır aralarına sıkıştırdığı bir konuşma yaşandı.

• Gen terapisi her zaman insanlığın yararı üzerine mi yapılıyordu? 
• Bir şeyin etik olması için iyi niyetin tek taraflı olması yeterli miydi? Örneğin, insanın doğası gereği var olan davranışlarını sürdürmesi bir diğer canlıyı etkiliyorsa iyi niyetten bahsedebilir miydik? 
• Bilim yapma endişesinden çok ticari kaynak sağlama politikasına yöneldikçe doğru yolda olduğumuzdan söz edebilir miydik? 
• Çoğunluğun kurtarılması amacıyla azınlığın denek olarak kullanılmasıyla geliştirilen ilaçların kullanımı adil miydi? 
• Ya da deneklerin ilaç tasarımı sırasında yan etkilerden dolayı kaybedildiğini bile bile o ilaç kullanılır mıydı? Kullanırım veya kullanmam demek arasında ne kadar da ince bir çizgi vardı aslına bakılırsa.. 
• Denek olarak hayvanların kullanılmasında insanlar olarak ne tür bir hakka sahiptik? Hayvanlara söz hakkı verilme gibi bir imkan olsaydı acaba neyi tercih ederlerdi? 

21 Temmuz

Bütün okuyucularımıza merhabalar;

Bu hafta benim için stajın son haftası olduğu için diğer haftalardan çok farklı ve hüzün dolu bir hafta olacak ve hatta olmaya başladı bile. Birlikte çalışmaktan ve vakit geçirmekten çok zevk aldığım staj arkadaşlarımdan ayrılmak gerçekten zor geliyor. Asıl zor olanı da Ahmet Hocamızın her söylediği, her yapmamızı istediği ve her anlattığı şey ile hayatımıza kattığı şeylerden uzak kalacak olmak. Gidiyorum ama aklım hep burada kalacak.

Adeta her şey beni gitmekten vazgeçirmek için planlanmış bir düzenmişcesine bugün hep beraber harika bir gün geçirdik. Ben de bu yazımda sizlere bugün geçirdiğimiz bu harika günde neler yaptığımızdan bahsedeceğim.

19 Temmuz 2014 - Hafta sonumuz...

Herkese merhabalar.

Günden güne daha iyiye giden gelişmelerin sonuçları olumlu oldukça, staj öncesinde ayrı ayrı olan biz stajyerler için aile ruhu kadar güzel olan, grup ruhumuz adeta tamamlanmamıza yol açıyor. Bu ruhun oluşması için bütün emeğini ortaya koyan Ahmet hocamıza ise çok teşekkür ediyorum. Stajımızın ikinci hafta sonunda uyanır uyanmaz koşarak geldiğimiz Genkök’te bir arada olmak, gerçekten de bizim için iç açıcı bir güzellik.

18 Temmuz Cuma

Merhaba arkadaşlar :)

Bugün stajımızda Ensembl Genome Browser üzerinde durduk. Bu web aracı, bize birçok organizmaya ait genom verilerine ulaşmamızı sağlıyor. En güzel tarafı, bizim ihtiyacımız olan verileri bize sunması. Fasta formatını istediğimiz verilerle yaratabilmemiz bizim işimizi çok kolaylaştıran bir yanı.

7 Temmuz Haftası

Geçen hafta tamamlanması gereken bu yazıyı ancak gönderebiliyorum, bu sıralar uyumaya dahi fırsat bulamadığım bir yoğunluğun içerisindeyim.

7 Temmuz, ekibimizin sayıca iki katına çıktığı gün, ve bu günü birkaç haftadır merakla bekliyordum. Sosyal psikolojiyi çok severim ve fırsat buldukça da okumaya çalışırım, bu alandaki ilgimi çeken en önemli konu ise grup davranışları. Teorik olarak, iki grubun karşılaşması durumunda ortaya çıkabilecek sorunlar, çözüm yolları, muhtemel yol haritaları vb. üzerine çok bilgim var, ve geçen hafta bu bilgiyi pratiğe dönüştürme imkanı buldum.

18 Temmuz Cuma - Veri Kaynaklarımız

                                                                                                  Devler gibi eserler bırakmak için , karıncalar gibi çalışmak lazım.

Necip Fazıl KISAKÜREK 

       Merhabalar ,  blogumuzdaki yazıları  acaba yarın ne olacak , ne yazılacak merakıyla takip eden tüm okuyucularımıza , takipçilerimize .

      Bugün güne elimizdeki verilerde incelemeler , hesaplamalar yaptığımız programlama dili olan  pythonda programlar yazarak başladık.Kullandığımız verileri hangi kaynaklardan elde ettiğimizi bugün ayrıntılı bir şekilde inceledik.Örneğin ensembl genom browser sitesinden  birçok canlı türüne ait gen dizilimlerine(genomlara ait bilgiler) ve farklı tür genomlara ait istatistiksel sonuçlara ulaşabilirsiz.

17 Temmuz- Bu İş Bu Kadar!

Herkese Merhabalar,

Size en son Django diye bir şeyin varlığından ve öğrenmenin ne kadar işkence olduğundan bahsetmiştim. Çok şükür Ahmet Hocamız bizi bu dertten de kurtardı. Farkındaysanız kendileri önce başımıza iş açıyor sonra yine kendisi çözüyor :) Çok uzun uğraşlarımıza rağmen Django' nun içinden çıkamayınca akıl sağlığımızın devamlılığını korumak için sağolsun yardımcı oldular. 1 saat gibi kısa bir sürede geceli gündüzlü üç gün uğraştuğımız Django ' yu alt etmeyi başardık. Aslında çok eğlenceli ve harika birşeymiş meğerse şu bizim Django. Ama gelin görün ki piyasada bu programı kullanmayı öğretecek adamakıllı bir kaynak bulunmadığı için öğrenirken epey zorlandık. Neredeyse Django 'nun kullanmadığımız sürümü okumadığımız kitabı kalmadı :). İstediğimiz sonucu aldığımızda gözlerimizdeki pırıltıyı görmeliydiniz. Hakikaten  o an bizim için muhteşem bir andı :). 

17 Temmuz

Merhabalar sevgili takipçilerimiz :)

Burada zaman çok hızlı akıyor, bir hafta ne kadar da çabuk geçti gerçekten. Temmuz grubu olarak hızlı ilerlediğimiz de söyleniyor zamanla yarışıyoruz sanırım :) Python'da fonksiyon yazmada epey pratik yaptık ve bir sonraki alıştırmalarımızı heyecanla bekliyorum. Bana kalsa ben bir an önce python da istediğim kodu yazmayı bilmek istiyorum, tabi bir anda o aşamaya gelinmiyor ama bu konuda çok sabırsızım. Haziran grubunun çalışmalarından duyduğum kadarıyla daha sırada Django ve D3 var.

Bugün Burak arkadaşımızın öncülüğünde microarray analizi adımlarını öğrendik. Bunun için öncelikle NCBI-GEO'da tanımlanmış gen setini kullandık ardından da Web-Gestalt'da sonuçların değerlendirmesini yaptık. Microarray çalışmamız sonrasında temmuz grubu olarak "puzzle"ımızı tamamladık.

Her akşam olduğu gibi iftar yemeğimizle günümüzü kapattık. Yemek sonrası da voleybol oynayarak çalışmalarımıza biraz ara vermiş olduk.

Haftaya yeni çalışma ve etkinliklerimizde görüşmek üzere,

Sevgiler.

16 Temmuz

Bir çarşamba daha merhaba,

Kendi adıma staj sürecimizin en yorgun ve uykusuz günlerini yaşıyorum Django yüzünden ama iki gündür Django'da kat ettiğimiz yol gösteriyor ki, onu alt ettik :)

16 Temmuz

Burada neler yaptığımızı merak eden herkese merhaba,

Yoğun ve hızlı geçen günlerin ardından yine yazma sırası bana geldi. Oldukça yorucu fakat bir o kadar da eğitici bir hafta geçirdik. Günlerin nasıl geçtiğini zaten diğer arkadaşlarımın yazılarından biliyorsunuzdur. Dün yaşadığım büyük süprizden dolayı bütün ekip arkadaşlarıma ve Ahmet Raşit Hocama teşekkür ediyorum. Yine yoğun bir gün geçirdik ve gece yarısı hala burada çalışıyoruz. Şuan herkesin çok yorgun olduğunu görebiliyorum fakat durmak var mı? Hayır tabi ki yok =).

15 Temmuz

Merhaba,

Temmuz grubunun gözünden Evrim'in de yazdığı gibi ben de bugün deneyimlediklerimizi Haziran grubunun gözünden aktaracağım. Dışarıdan bir gözle bakıldığında kimi zaman yaşanılanlar aynı gibi gözükse de algıdan algıya değişeceği gibi grubun gözünde de bir çok şey daha farklı anlamlanıyor. Bu farklı algının en önemli nedeninin geçirilen zamanın diğer gruba göre fazlalığının üzerimizdeki etkisi olduğunu düşünüyorum.

15 Temmuz

Stajımızı takip eden herkese merhaba,

Temmuz grubu olarak stajdaki ikinci haftamıza girmiş bulunmaktayız. Bu haftanın ikinci gününe

Gen-Kök Merkezi'nin müdür yardımcısı Servet Hoca ve çalışanlarıyla öğle yemeği yiyerek başladık. Ardından bir gün önce belirlenen konularımızı, sunum tekniklerimizi biraz daha geliştirerek sunmaya çalıştık. Sunumlarımız da bitince günün geri kalanı ve ertesi gün için yapılacakların planını oluşturduk. 

14 Temmuz

Bu stajda neler yapılıyor diye merak eden herkese merhabalar,

Dolu dolu çalıştığımız 26 gün geride kaldı ve bugün 27. günümüze girmiş bulunuyoruz. Ben ise sizlere 26. günümüz olan 14 Temmuz Pazartesi neler yaptığımızdan bahsedeceğim bu yazımda. Ama öncesinde de kısaca hafta sonunu özet geçmeyi planlıyorum.

14 Temmuz 2014- Print or Return Python'lu Günler

Merhabalar, ben Fatma. Bu yaz Genkök'te gerçekleşen Biyoinformatik stajının katılımcılarından biriyim. İstanbul Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik mezunuyum, yoluma Selçuk Üniversitesi Ziraat Fakültesi'nde devam etmekteyim. Yaz Stajı ortak blogumuz dışında bilimhatunu.wordpress.com'da da farklı konularda yazmaktayım. 

Yaklaşık bir haftadır burada yoğun bir tempo eşliğinde gecemizi gündüzümüze katıp çalışıyoruz. Bu blogu takip edenler ekibin öğrenmek adına yüksek motivasyona sahip olduğunu ve zaman zaman staj yerimizde sabahladıklarını okumuş olmalılar. Ben de ilk geldiğim gün burada ertesi gün yapacağım sunum için sabahlamıştım, benim için oldukça iyi bir giriş oldu.

13.07.2014 - Harika Bir Gün

 Harika Bir Gün

 Verimli, yoğun ve yorucu bir haftanın sonuna gelmiştik, peki en güzel şekilde nasıl eğlenebilirdik? Bunun cevabı belliydi aslında Harikalar Diyarına gitmek için saatlerimiz ayarlandı ve buluşma yerimiz Starbucks' da grubumuz toplandı. Bazı arkadaşlarımız yokluğu ekibi eksik bıraksa da, gitmek için hazır olan grup üyelerimiz “Ayşegül, Emre, Fatma, Evrim, Çağla ve Çağlanın arkadaşı Burak” şimdilik toplanmış gibi gözüküyordu.

12 Temmuz 2014 - Renkli Günler Stajı :)

Herkese Merhabalar,

Biyoinformatik yaz stajımızın rengârenk günlerine hoş geldik...

Başlangıcından bitişine çok yoğun, bilgi dolu, farklı, heyecanlı, bazen hüzünlü ama oldukça güzel günlere sahip ilk haftamız bitiyor. Geçen her günün ardından ise kalan tüm günlerde kullanılacak birikimlerimizin sahibi oluyoruz. Yeni bir deneyim olmasının verdiği tüm tedirginliklerin yavaş yavaş yok olmasını sağlayan Ahmet hocama, ismiyle gülümsemelere neden olan sevgili 'Haziran' grubunun ve tabi ki benimde dahil olduğum 'Temmuz' grubunun üyelerine ayrı ayrı teşekkürü bir borç bilirim.;) 

11 Temmuz - Farklı Bir Dünya

                                                                           

          Zorluklar, başarının değerini artıran süslerdir.  

Moliere       

Merhaba, 

"Biyoinformatik Yaz Stajı" programına katılan ekibin yeni bir üyesi olarak blogumuzu takip eden herkese selamlar. Ben burada, cuma günleri staj programımızda neler yaptığımızdan, stajdaki edindiğimiz kazanımlardan ve staj hakkındaki düşüncelerimden bahsedeceğim.

11 Temmuz

Merhaba arkadaşlar,

Bu hafta Temmuz Grubundaki arkadaşlarımız ile ilk haftamızı bitirdik. Yeni gelen arkadaşlarımız çok hızlı bir şekilde staja adapte oldular ve motivasyonları çok yüksek. Bugün elimden geldiğince yeni arkadaşlara Python anlatmaya çalıştım. Herkes öğrenmeye çok açık ve uzun süreler problemlerle uğraşabiliyorlar. Bizleri hızlı bir şekilde yakalayıp projelerimize çabucak dahil olabileceklerini görebiliyorum.

Neler kazandım..

Merhaba arkadaşlar,

Bu hafta hem mutlu hem hüzünlü bir haftayı bir araya sıkıştırarak diğerlerine kıyasla daha duygu dolu bir hafta geçirdik. Uzun bir zamandır ne kendi blog sayfamda ne de ortak blog sayfamızda paylaşımlar yapamıyordum. Kişisel sebeplerimden dolayı bu hafta perşembe günü ekip arkadaşlarımdan ayrılmak zorunda kalarak Bolu'ya dönmem gerekti. Bugüne kadar kendi açımdan ve ekibin bir üyesi olarak neler kazandığımı sizinle paylaşmayı sağolsun Ahmet Hocamızda uygun gördüğü için ortak blog da yazma kararı aldım, umarım size de bir faydası dokunur :)

10 Temmuz - Biyoinformatiğe Genel Bakış

Merhabalar,

Biyoinformatik 2014 yaz stajına, 7 temmuz pazartesi başladım ve hızlıca adapte olmaya çalışıyorum. Staj hakkındaki duygu ve düşüncelerime, geniş anlamda kişisel blogumda  yer vermeyi planlıyorum. Perşembe günleri de edindiğim bilgileri buradan sizlerle paylaşıyor olacağım.

10 Temmuz - Gitmelere de Eyvallah

Yeniden Herkese Merhaba,

Temmuz grubunun da aramıza katılmasıyla ekibimiz daha da kalabalıklaştı. Onlarla da çok çabuk kaynaştık ve daha iyisi için daha büyük bir ekip haline geldik. Çalışma ortamımızı sığabilmek için epey bir değiştirmemiz gerekti. Onların bazı konularda bizden daha şanslı olduklarını düşünmüyor değilim. En azından biz de aynı yoldan geçtiğimiz için onların nerelerde zorlanabileceklerini ve nasıl açıklanırsa anlayacaklarını kestirebiliyoruz.  Diğer ekip arkadaşların yazılarından “Temmuz Grubu” grubu hakkkında yeterince fikir sahibi olduğunuzu varsayıyorum :) Ben bugün size gelenlerden değil de gidenlerden bahsedeceğim aslında. Hiç sevmesemde biraz duygusala bağlamayı düşünüyorum biyoinformatik namına çok bir şey beklememenizi öneririm :)

9 Temmuz

Merhabalar,

İkinci ayımıza başladığımız bu hafta, hepimiz için daha farklı geçiyor. Bildiğiniz gibi Temmuz grubu da haftanın başında aramıza katıldı. Birbirimize alışmaya başladık bile bence. Ekip kalabalık olunca beraber hareket etmek ister istemez daha zor olsa da üstesinden gelemeyeceğimiz bir şey yok tabii ki :).

09 Temmuz 2014

Bizi takip eden herkese merhaba. Bugün temmuz grubu için stajın 3. günü haziran grubu için ise 23. gün olmuş bile. Bu gün neler yaptığımızı anlatmadan önce staj ortamından bahsetmek istiyorum.

Bugün haziran ve temmuz grupları olmak üzere toplamda 12 kişilik bir toplulukla geçirdiğim 3. gün bitti. Ve şimdiye kadar gördüğüm en güzel staj grubu olduğunu söyleyebilirim. Haziran grubu geçirdikleri 1 aylık süreç içinde çok iyi çalışma ile olağanüstü bir bilgi  birikimine sahip durumda  ve bunu sürekli bizimle paylaşıyorlar ve önümüzde bu süreci çok daha yeni atlatmış bir grup oldukları için sıkıntılarımızı da çok iyi anlayabiliyorlar. Ahmet Raşit Hocamızın  bu gruplar arasında oluşturduğu denge sayesinde, saygı çerçevesi içerisinde oldukça eğlenceli zaman geçiriyoruz diyebilirim. Önümüzdeki günlerde bizi daha güzel günlerin beklediğini düşünüyorum.

8 Temmuz

Merhaba;
 

Eğitimimize başladıktan sonra geçen bir ay sürecinde az olmamızın ve beklentilerin ortak olmasının verdiği avantajla günlerimizi oldukça verimli geçirerek kendimizi Temmuz grubunun eğitimi için hazırladık. Bu süreç genellikle çok keyifli kimi zamanda sancılı geçti. Şimdi ise dün de Emre' nin bahsettiği gibi yeni arkadaşlar aramıza katıldı.

7 Temmuz

Merhabalar Arkadaşlar,

Bugün stajda ki 2. ayımıza girmiş bulunmaktayız. Hiç farkında olmadan çok güzel şeyler öğrenerek ve birbirimizle harika ilişkiler kurarak dört hafta geçirdik. Beşinci haftamız olan bu hafta ise diğer haftalardan daha farklı bir haftaya girmiş bulunmaktayız çünkü artık altı kişiden oluşan staj ekibimiz kalabalıklaştı ve yedi yeni arkadaşımızın da aramıza katılması ile artık 13 kişiyiz. Bu durumun etkisiyle de daha farklı bir sürecin içine girmiş olduk ve bu sürecin nasıl ilerleyeceği bizler için büyük bir merak konusu. Bugün gelen yeni arkadaşlarımızın heyecanlarını, meraklarını ve endişelerini görünce bir an için kendi ilk günümü ve geçen bir ayda farkında olmadan nasıl bu kadar ilerleyebildiğimizi düşündüm. Bunları düşünürken de kendimi gerçekten çok şanslı hissettim çünkü çok güzel bir ay geçirdik ve bugün ile başlayan ikinci ayımızın da aynı şekilde ilerlemesi en büyük temennimiz. 

30 Haziran Haftası

Çalışmalarımızın 4. haftasını da geride bıraktık, ve zaman su gibi akıp geçiyor. Ancak katettiğimiz yola baktığımızda olağanüstü bir performans sergilendiğine şahit oluyorum. Bu hafta yeni bir kavramla daha tanıştırdığım ekibimi sürekli zorladığımı hissediyorum, ancak onlar da bundan gayet keyif alıyor görünüyorlar :) Kendi bakış açımla bu hafta neler yaptığımızdan bahsetmek istiyorum.

5 Temmuz

Merhaba arkadaşlar,

Bu hafta yoğun fakat sonu güzel biten bir hafta geçirdik. Geçen hafta başladığımız miRNA fonksiyonumuzu bu hafta gerçek verilerle test ederek ve üzerinde geliştirme yaparak tamamlamamız aslında ne kadar da doğru bir yolda çaba gösterip ilerlediğimizin kanıtı oldu. Ayrıca son dakikalara sıkıştırılmış Django eğitimiyle hepimiz kendimize birer  web sayfası oluşturmayı öğrendik.

4 Temmuz

Bugün 4. haftamızın sonuna geldik. TUNA Projesi için Django'ya giriş yaptık. 

Django bizlere biraz farklı geldi. Çünkü biraz alışılmışın dışındaydı. Diğer web çatılarına göre daha ayrık ve karmaşık gibi görünüyordu. Başta alışılması zor olan bu durumun aslında bize büyük bir faydası var, elimizdeki problemleri daha küçük parçalara ayırarak çalışabiliyoruz. Bu yüzden başlarda zorlanabiliyoruz fakat alıştıktan sonra çok kolay ve pratik olarak kullanabileceğiz.

3 Temmuz- Nerden Çıktı Bu Django?

Yeniden Herkese Merhaba,

Kaldığımız yerden devam ediyoruz programımıza. TUNA Projemizin kod yazma kısmını büyük oranda tamamladık diyebilirim. Arka planı belli bir aşamaya geldi. Peki ya ön planda istediğine ulaşmak isteyen kullanıcılara nasıl bir şey sunulacak? Bunun için Web tabanlı hale getirilmesi gerekiyor. Web tabanlı hale getirilmesi ve görselliği hem kullanıcıların kolay kullanması hem de anlaması için en az kod kısmı kadar önemli. Peki biz bunun için ne yapacağız :) "Django"

2 Temmuz

Merhabalar, 

Dördüncü haftamızı da yarıladık. Bugünümüzün asıl olayı geçen hafta başladığımız miRNA projemizin kodunu bitirmemiz va çalıştırmamız oldu. Son bir pürüzü hallettikten sonra projemiz bitmiş olacak. Kod  yazmakla ilgili bugün söylemek istediğim asıl şey ise son iki gündür kullandığımız teknik.

1 Temmuz

3 haftayı geride bıraktığımız bugünlerde güne Skype görüşmesi ile başladık. Özel bir şirketin müdürü olan Zeynep ÇETEREZ’ in girişimcilik üzerine konuşmaları bize oldukça faydalı oldu. Ahmet Raşit Hocamızın bizim tek yönlü yetiştirilmemiz yerine bu alanlarda da fikrimiz olması gerektiğini düşündüğünden gerçekleştirdiğimiz bu görüşmede; şirket nasıl kurulur, kurulurken finans ne tür yerlerden sağlanır, ortak ile birlikte şirket kurmanın tek başına kurmaktan farkı nedir, proje yazarak hangi burslardan yararlanabiliriz, mikrokobi şirketlerin büyümesi için yardımcı derneklerin verdiği kilit bilgilerle şirket nasıl büyür, reklam ve pazarlamanın önemi nedir ve nasıl yapılmalıdır gibi genel başlıklar altında detaylı bir şekilde konuştuk. Sonunda ise sorularımızı sorduk ve yeterli cevaplar aldık. Görüşmenin sonunda artık her birimizin şirket kurmanın ilk adımı nasıl atılırdan itibaren kuvvetli nedenlere bağlayabileceğimiz fikirlerimiz oluştu. Her hafta Skype görüşmelerimizle bize destek olan hocalarımız sayesinde hayatımızı hangi yöne doğru şekillendireceğimiz konusunda da daha kararlı olmaya başladığımızı söyleyebilirim.