Bugün stajımızın 7.gününde neler
yaptığımızdan bahsedeceğim. Her bir
arkadaşımın her gün neler yaptığımızı paylaşması ile bir haftayı tamamladık. Bu gün
güne Emin ÇAPA’ nın Pazarlama Zirvesi’ndeki sunumu izleyerek başladık. Sunumu
izlememizin temel nedeni Emin Bey’ in sunum yapış tarzının gayet etkileyici
oluşu ve ondan çok şey öğrenecek oluşumuzdu.
Uzun bir sunum olmasına rağmen zamanın nasıl geçtiğini anlayamadık; kimi zaman bol kahkahalı, kimi zaman beynimizde yeni ufukların
açılması ile izlemeye devam ettik. Sunumun sonunda kendi aramızda yaptığımız
tartışma da da Emin Bey’in sunumda gözlemlediğimiz özelliklerin hangilerini kendimize
katabileceğimiz hakkında fazlasıyla kafa yorduk. Farkındalık için, sunumdan
daha fazlasını görebilmek için sizlerin de izlemesini tavsiye ederim.
Videodan sonra Python programlama dilinde
kod yazmaya başladık. Tuna adını koyduğumuz ortak projemiz için hangi kodları
oluşturmamız gerektiği hakkında fikir yürüttük. Dün UCSC Genome Browser ve
Ensembl’dan indirdiğimiz transkriptleri/genleri/mRNA’ ları kullanarak
seçtiğimiz genin 180 bp’lik kısmında DNA, RNA ve Protein sekansları ile ilgili
kodlar yazdık. Burada amaçladığımız şey şuydu; elimizde bulunan
sekansın DNA sekansı mı yoksa RNA sekansı mı olduğunu kod yazıp tespit etmek,
ayrıca var olan sekansta N karakteri var mı ya da sekansta geçersiz bir harf var
mı bunu belirlemek ve geçersiz bir harf varsa
bunu bize hata olarak göstermesini sağlamak, sonrasında ise hata
sayısını belirlemekti. Diğer bir kodumuz DNA sekansını RNA sekansına çevirmek
ya da tam tersi RNA sekansını DNA sekansına çevirmek için yazıldı. Proteinde ise yapmamız gereken var olan DNA sekansını kodonlara ayırmak ve her
bir kodona karşılık gelen aminoasitleri atayarak amino asit sekansını
oluşturmaktı. Ayrıca virile nükleotit sekansının ters komplementerini verecek olan kodu da yazdık. Bu kodları oluştururken countBase, countWords, wordCount, sortCounts,
generateCodons ifadelerini kullandık. Yazdığımız her kodu çalıştırdıktan sonra
kodumuzu daha sonra tekrar kullanacağımız için wikiye ekledik.
Daha sonra her Salı olduğu gibi bizi
kişisel olarak geliştireceğini düşündüğümüz ayrıca eğlendiren filmlerden birini
izledik. İzlediğimiz film Internship idi. Bu
filmi izlemediyseniz eğer izlemenizi tavsiye ediyorum. Filmde de en az bizim
kadar eğlenen, öğrenen ve birlik olan stajyerlerin yaşadıkları olaylar ve
olumsuz durumların üstesinden nasıl gelinebileceği çok güzel bir şekilde
anlatılmıştı.
Sevgiler,
Bihter
Hiç yorum yok:
Yorum Gönder