18 Haziran 2014 Çarşamba

17 Haziran

Bugün stajımızın 7.gününde neler yaptığımızdan bahsedeceğim.  Her bir arkadaşımın her gün neler yaptığımızı paylaşması ile bir haftayı tamamladık. Bu gün güne Emin ÇAPA’ nın Pazarlama Zirvesi’ndeki sunumu izleyerek başladık. Sunumu izlememizin temel nedeni Emin Bey’ in sunum yapış tarzının gayet etkileyici oluşu ve ondan çok şey öğrenecek oluşumuzdu.  Uzun bir sunum olmasına rağmen zamanın nasıl geçtiğini anlayamadık; kimi zaman bol kahkahalı, kimi zaman beynimizde yeni ufukların açılması ile izlemeye devam ettik. Sunumun sonunda kendi aramızda yaptığımız tartışma da da Emin Bey’in sunumda gözlemlediğimiz özelliklerin hangilerini kendimize katabileceğimiz hakkında fazlasıyla kafa yorduk. Farkındalık için, sunumdan daha fazlasını görebilmek için sizlerin de izlemesini tavsiye ederim.

Videodan sonra Python programlama dilinde kod yazmaya başladık. Tuna adını koyduğumuz ortak projemiz için hangi kodları oluşturmamız gerektiği hakkında fikir yürüttük. Dün UCSC Genome Browser ve Ensembl’dan indirdiğimiz transkriptleri/genleri/mRNA’ ları kullanarak seçtiğimiz genin 180 bp’lik kısmında DNA, RNA ve Protein sekansları ile ilgili kodlar yazdık. Burada amaçladığımız şey şuydu; elimizde bulunan sekansın DNA sekansı mı yoksa RNA sekansı mı olduğunu kod yazıp tespit etmek, ayrıca var olan sekansta N karakteri var mı ya da sekansta geçersiz bir harf var mı bunu belirlemek ve geçersiz bir harf varsa bunu bize hata olarak göstermesini sağlamak, sonrasında ise hata sayısını belirlemekti. Diğer bir kodumuz DNA sekansını RNA sekansına çevirmek ya da tam tersi RNA sekansını DNA sekansına çevirmek için yazıldı. Proteinde ise  yapmamız gereken var olan DNA sekansını kodonlara ayırmak ve her bir kodona karşılık gelen aminoasitleri atayarak amino asit sekansını oluşturmaktı. Ayrıca virile nükleotit sekansının ters  komplementerini verecek olan kodu da yazdık. Bu kodları oluştururken countBase, countWords, wordCount, sortCounts, generateCodons ifadelerini kullandık. Yazdığımız her kodu çalıştırdıktan sonra kodumuzu daha sonra tekrar kullanacağımız için wikiye ekledik.



Daha sonra her Salı olduğu gibi bizi kişisel olarak geliştireceğini düşündüğümüz ayrıca eğlendiren filmlerden birini izledik. İzlediğimiz film Internship idi. Bu filmi izlemediyseniz eğer izlemenizi tavsiye ediyorum. Filmde de en az bizim kadar eğlenen, öğrenen ve birlik olan stajyerlerin yaşadıkları olaylar ve olumsuz durumların üstesinden nasıl gelinebileceği çok güzel bir şekilde anlatılmıştı.
Sevgiler,

Bihter

Hiç yorum yok:

Yorum Gönder